Araştırma Merkezi Komutanlığı 1998 yılında Deniz Kuvvetleri Komutanlığı Araştırma, Proje Geliştirme ve Bilimsel Karar Destek Başkanlığı'na bağlı olarak Gölcük-Kocaeli'nde kurulmuştur. 17 Ağustos 2001 tarihinden bu yana Pendik-İstanbul'daki yeni binasında faaliyetlerine devam etmektedir.

   Araştırma Merkezi Komutanlığı Türk Deniz Kuvvetleri unsurlarının gelecekteki deniz savaş sistemleri ihtiyaçlarını karşılamak maksadıyla uygulamalı araştırma yapacak, görev kritik alanlarda yeni teknolojiler üretecek, kalite ölçütlerine uygun olarak özgün sistemler geliştirecektir. 
   Araştırma Merkezi Komutanlığı uzmanlık alanlarında yeni teknolojiler geliştirilmesi konusunda ulusal savunma sanayine öncülük edecek, bu maksatla kendine tahsis edilen kaynaklara ilave olarak ulusal ve uluslararası AR-GE ve sanayi kurumları ile işbirliği ve ortak çalışma kültürünü de geliştirecektir.

   Türk Deniz Kuvvetlerinin deniz savaş sistemleri teknolojilerinde harekat ihtiyaçlarını desteklemek maksadıyla; savaş yönetim sistemleri, atış kontrol ve hedef izleme sistemleri, sualtı sensör ve sistemleri, EH ve EO sistemleri, modelleme ve simülasyon, muhabere ve link sistemleri,alanlarında; uygulamalı araştırma ve gerektiğinde teknoloji gösterimi yapmak, sistem mühendisliği disiplinlerine uygun sistem analiz, tasarım, sistem geliştirme, test/entegrasyon ile sistem prototipini gerçekleştirmek, Donanma unsurlarının kızıl ötesi, RKA ve akustik imza yönetimi ile akustik ve EH bilgi bankasını yönetmek ve geliştirmek, suüstü, sualtı ve uçar unsurlar ile ilgili harp silah ve araçlarının test ve deniz tecrübelerine uzman desteği sağlamak AR-GE tedarik projelerinin teknik yönetimini gerçekleştirmektir.